Né en 1805 à Bâle, Johann Jakob Herzog étudie la théologie aux universités de Bâle et de Berlin, où il obtient son doctorat en 1830. Professeur de théologie historique à l'Académie de Lausanne de 1835 à 1846, il enseigne ensuite à Halle avant de s'installer en 1854 à Erlangen comme professeur d'histoire de l'Église. Spécialiste de l'histoire de la Réforme — Zwingli, Calvin, Œcolampade — et de l'Église vaudoise, il est surtout connu pour son œuvre monumentale, la Real-Encyklopädie für protestantische Theologie und Kirche, encyclopédie en vingt-deux volumes publiée entre 1853 et 1868, qui connaît une nouvelle édition en dix-huit volumes de 1877 à 1888 et sera à l'origine de la version anglaise abrégée The New Schaff-Herzog Encyclopedia of Religious Knowledge. Il meurt en 1882.